Formaliai savivaldybė įkurta 1994 m. liepos 19 d. Visagino mieste, teritoriją atskiriant nuo Ignalinos rajono. 1995 m. kovo 25 d. įvyko vietos savivaldos rinkimai. Iki 2003 m. sausio 1 d. Visagino savivaldybę sudarė tik Visagino miestas, tačiau įsigaliojus Ignalinos ir Visagino savivaldybių ribų keitimo įstatymui, Visagino savivaldybei buvo priskirti šiauriniai Rimšės seniūnijos (Ignalinos rajono savivaldybė) kaimai, savivaldybės plotas padidėjo nuo 896 ha iki 5841 ha.
Energetikų g. seniūnaitija: Taikos pr. poriniai numeriai: 64/26, 64, 66, 68, 70, 72A, 72B, 72V,74, 74B, 76, 78A, 78B, 80, 80A, 84, 88, 88A. Taikos pr. neporiniai numeriai: 25, 27, 29, 31, 33, 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49. Statybininkų g. poriniai numeriai: 22, 24, 26. Draugystės g. neporiniai numeriai: 1, 3, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31. Energetikų g. poriniai numeriai: 6, 8, 10, 12, 14, 16.
Karlų seniūnaitija: Čeberakų k., Karlų k., Makaravo k., Babrūšos k., Drūkšinių k., Mantvilų k., Petriškės k., Serbiejiškės k., Skrytelių k., Stabatiškės k., Šaškų k., Tumelinos k.
Kosmoso g. seniūnaitija: Kosmoso g. poriniai numeriai: 14/1, 16, 18, 28, 28A, 30, 30A, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44. Kosmoso g. neporiniai numeriai: 5, 7, 9 A, 9 B, 9C. Taikos pr. neporiniai numeriai: 1,1A, 1B, 1C, 3, 5, 7, 7A, 7B, 9, 9A, 9B, 11, 13, 15, 15A, 15B, 15 °C, 15 D, 15E, 15H. Taikos pr. poriniai numeriai: 4, 6, 8, 8A, 8B, 8C, 8D, 10, 10A.
Magūnų seniūnaitija: Ažukalviškės k., Julionių k., Juliškės k., Kalviškių k., Lapušiškės k., Magūnų k., Ramybės k., Ramybės I k., Tiltelio k.
Santarvės g. seniūnaitija: Veteranų g. poriniai numeriai: 2, 4, 6, 8, 10. Tarybų g. neporiniai numeriai: 3, 5, 5A, 6, 8, 10, 12, 14, 16. Sedulinos al. neporiniai numeriai: 21, 23. Santarvės g. neporiniai numeriai: 1. Statybininkų g. neporiniai numeriai: 1, 3, 5, 7.
Sedulinos al. seniūnaitija: Festivalio g. neporiniai numeriai: 1, 1A, 3, 3A, 5, 5A, 7, 7A, 9, 11, 13, 15, 17. Festivalio g. poriniai numeriai: 2, 2A, 2B, 2C, 2D, 6, 6A, 8, 8A, 10. Kosmoso g. poriniai numeriai: 2, 4, 6, 8, 12, 12A. Sedulinos al. neporiniai numeriai: 1, 3, 5, 5A, 5B, 7, 9, 11. Sedulinos al. poriniai numeriai: 4, 4A, 6, 6A, 6B, 8, 10, 12, 12A, 14, 14A. Parko g. poriniai numeriai: 2, 2A, 2B, 2 °C, 2E, 2H, 4, 6, 8, 10, 12, 12A, 14, 16, 16A. Parko g. neporiniai numeriai: 1, 7, 7B, 11, 13, 15, 17, 19. Visagino g. neporiniai numeriai: 5. Vilties g. poriniai numeriai:2, 4, 8, 10, 12, 14. Vilties g. neporiniai numeriai: 1, 3, 5, 5A. Partizanų g. poriniai numeriai: 2.
Taikos pr. seniūnaitija: Veteranų g. poriniai numeriai: 12, 14, 16, 20, 22. Tarybų g. neporiniai numeriai: 9, 11, 15, 17, 21, 23. Taikos pr. poriniai numeriai: 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58. Statybininkų g. neporiniai numeriai: 9, 11, 13, 15/62.
Vilties g. seniūnaitija: Taikos pr. neporiniai numeriai: 17, 17A, 19, 21, 23, 23A, 23B, 23C, 23D, 23E. Taikos pr. poriniai numeriai: 12, 12A, 14, 16, 18, 20, 20A, 22, 24, 26, 26A, 28, 30, 30A, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44/19. Veteranų g. neporiniai numeriai: 5, 9, 11, 13, 15, 17. Vilties g. neporiniai numeriai: 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 23A, 23B. Vilties g. poriniai numeriai: 16, 16A, 18, 20. Visagino g. poriniai numeriai: 2, 4, 8, 10, 12, 14, 16, 16A, 18. Sedulinos al. poriniai numeriai: 16, 18, 20, 20 A, 20B. Parko g. neporiniai numeriai: 21, 23, 25/1. Partizanų g. poriniai numeriai: 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16.