LFF Antra lyga arba LFF II lyga yra trečios pakopos pirmenybės. 2020 m. pirmenybes sudarė dvi zonos. Pietų zonoje kovojo komandos iš Aukštaitijos, Vilniaus, bei pietinės Lietuvos. Vakarų zonoje žaidė komandos iš Žemaitijos ir Klaipėdos krašto. Pietų zonos varžybas organizuoja Kauno AFF, Vakarų zonos - Telšių AFF.
Pranešimuose neminimi pernai II lygos dalyviai FK Akmenės Cementas ir Kelmės FK-VJSM bei pašalinta iš A lygos FK Palanga. Klaipėdos Atlantas B bei Palanga B buvo išformuoti po to kai paaiškėjo kad šių klubų pagrindinės komandos bus pašalintos iš A lygos. FK Akmenės Cementas savo Facebook puslapyje pranešė kad šių metų varžybose nedalyvaus dėl žaidėjų trūkumo.[3]Kelmės FK-VJSM planai paaiškėjo kai buvo paskelbti III lygos dalyviai - komanda žais III lygos Šiaulių zonoje "Kelmės FK Kražantė" pavadinimu.
LFF II lygos žaidėjų registracijos periodas (perėjimų langas) buvo atviras nuo vasario 2 d. iki rugpjūčio 31 d.
Komandoje galėjo būti registruoti ne daugiau 30 žaidėjų, tame tarpe 4 ne ES piliečiai. Rungtynėse vienu metu komandos sudėtyje aikštėje galėjo žaisti 3 ne ES piliečiai.
Dublerinėse („B“ ir „C“) komandose, rungtynėms galėjo būti registruojami 2 pagrindinės komandos aikštės žaidėjai ir 1 vartininkas, bei neribotas kiekis žaidėjų ES piliečių iki 21 metų. Dublerinėse komandose rungtynėse vienu metu komandos sudėtyje aikštėje galėjo žaisti 5 ne ES piliečiai, tame tarpe 4 virš 21 metų amžiaus.[4]
Dėl kilusios COVID-19 viruso pandemijos sezono pradžia buvo uždelsta, ir norint sutrumpinti šį sezoną varžybos vyko 1,5 rato sistema: po pirmojo rato dalyviai buvo padalinti į dvi grupes, ir antrasis ratas vyko tik tarp savo grupės komandų.
LFF prezidentas ir generalinis sekretorius 2020 m. rugsėjo mėn. duotame interviu užsiminė, kad šiame sezone lažybų ir sutartų rungtynių problema labiausiai pastebima Antroje lygoje. Apie konkrečius atvejus nebuvo pranešta.[5][6]
FK Neptūno klubas sureagavo į šią įsišaknijusią problemą, surengdami prevencinį pristatymą „Ką turi žinoti apie manipuliacijas futbolo rungtynėmis (Match-fixing)“. Pristatymą vedė LFF Drausmės komiteto vadovas Andrius Remeika, kuris sveikino klubo iniciatyvą informuoti klubo žaidėjus ir narius apie futbolo rungtynių manipuliavimo būdus, kaip vyksta šių reiškinių stebėjimas ir kokios taikomos prevencinės priemonės žaidėjams ar klubui. Tai pirmas atvejis, kai klubas pats pasikviečia drausmės komisijos sekretorių pristatyti ir pateikti visą informaciją apie rungtynių manipuliacijas. Lietuvoje dėl manipuliacijų į LFF Drausmės komiteto akiratį patenka apie 1% rungtynių.[7]
↑ 1,01,1Pagal lygos taisykles, galutinėje įskaitoje klubams suris po vienodai taškų, žaidžiamos papildomos rungtynės dėl aukštesnės vietos lentelėje. Šiuo atveju, kai rungtynėse vyksta dėl nugalėtojo vardo, vadinamos auksinėmis rungtynėmis. Auksines rungtynes po pratęsimo FK Banga B laimėjo prieš FK Neptūną rezultatu 5:4 (3:3).
↑ 2,02,1Rungtynės atidėtos, o vėl įsigaliojus karantinui 2020 m. lapkričio 12 d. TAFF nusprendė kad rungtynės nebevyks ir čempionatas skelbiamas užbaigtu.[10]
↑ 1,01,11,21,3Rungtynės atidėtos, o vėl įsigaliojus karantinui 2020 m. lapkričio 12 d. TAFF nusprendė kad rungtynės nebevyks ir čempionatas skelbiamas užbaigtu.[11]