Nukleotidas

Straipsnis iš Vikipedijos, laisvosios enciklopedijos.
Peršokti į: navigaciją, paiešką
Nukleotidas – monomeras, sudarantis biopolimerą DNR.

(Deoksi)nukleotidai – (deoksi)nukleozidų, kurie sudaryti iš heterociklinės bazės ir cukraus, fosfatai. Iš jų net tik sudaromi biopolimerai DNR ir RNR, bet jie įeina ir į kai kurių kofaktorių (NAD, NADP, KoA, FAD, FMN) sudėtį. Nukleotidai atlieka svarbų vaidmenį ląstelės metabolizme, signalo perdavime.

Nomenklatūra[taisyti | redaguoti kodą]

Nukleotidų pavadinimai sudaromi iš keturių raidžių.

  • Pirmoji (mažoji) nurodo ar nukleotidas yra ribonukleotidas, ar deoksiribonukleotidas. Ribonukleotido atveju pirmoji raidė nerašoma, o deoksiribonukleotido atveju rašoma d.
  • Antroji (didžioji) raidė nurodo kokia heterociklinė bazė įeina į nukleotido sudėtį:
G: Guaninas
A: Adeninas
T: Timinas paprastai aptinkamas DNR sudėtyje
C: Citozinas
U: Uracilas paprastai aptinkamas RNR sudėtyje
  • Trečioji (didžioji) raidė nurodo kiek fosforo rūgšties liekanų yra nukleotido sudėtyje: viena (M; Mono-), dvi (D; Di-), trys (T; Tri-).
  • Ketvirtoji raidė P nurodo, kad sudėtyje yra fosforo rūgšties liekanų.

Pavyzdžiui, deoksi citidin tri fosfatas sutrumpintai žymimas dCTP.

(Deoksi)nukleotidų struktūra[taisyti | redaguoti kodą]

(Deoksi)nukleotido sudedamosios dalys

Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie ribonukleozidų, turime ribonukleotidus, jei prie dezoksiribonukleozidų – dezoksiribonukleotidus. Pirmieji yra RNR monomerai, antrieji – DNR monomerai. Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie adenozino 5'-hidroksilo grupės, turime adenozin-5'-fosfatą, jei prie uridino 2'-hidroksilo grupės – turime uridin-2'-fosfatą, jei prie dezoksitimidino 3'-hidroksilo grupės – dezoksitimidin-3'-fosfatą.

Nukleotidai[taisyti | redaguoti kodą]

Chemical structure of adenosine monophosphate
Adenozinmonofosfatas
AMP
Chemical structure of adenosine diphosphate
Adenozindifosfatas
ADP
Chemical structure of adenosine triphosphate
Adenozintrifosfatas
ATP
Chemical structure of guanosine monophosphate
Guanozinmonofosfatas
GMP
Chemical structure of guanosine diphosphate
Guanozindifosfatas
GDP
Chemical structure of guanosine triphosphate
Guanozintrifosfatas
GTP
Chemical structure of thymidine monophosphate
Timidinmonofosfatas
TMP
Chemical structure of thymidine diphosphate
Timidindifosfatas
TDP
Chemical structure of thymidine triphosphate
Timidintrifosfatas
TTP
Chemical structure of uridine monophosphate
Uridinmonofosfatas
UMP
Chemical structure of uridine diphosphate
Uridindifosfatas
UDP
Chemical structure of uridine triphosphate
Uridintrifosfatas
UTP
Chemical structure of cytidine monophosphate
Citidinmonofosfatas
CMP
Chemical structure of cytidine diphosphate
Citidindifosfatas
CDP
Chemical structure of cytidine triphosphate
Citidintrifosfatas
CTP

Deoksinukleotidai[taisyti | redaguoti kodą]

Chemical structure of deoxyadenosine monophosphate
Deoksiadenozinmonofosfatas
dAMP
Chemical structure of deoxyadenosine diphosphate
Deoksiadenozindifosfatas
dADP
Chemical structure of deoxyadenosine triphosphate
Deoksiadenozintrifosfatas
dATP
Chemical structure of deoxyguanosine monophosphate
Deoksiguanozinmonofosfatas
dGMP
Chemical structure of deoxyguanosine diphosphate
Deoksiguanozindifosfatas
dGDP
Chemical structure of deoxyguanosine triphosphate
Deoksiguanozintrifosfatas
dGTP
Chemical structure of deoxythymidine monophosphate
Deoksitimidinmonofosfatas
dTMP
Chemical structure of deoxythymidine diphosphate
Deoksitimidindifosfatas
dTDP
Chemical structure of deoxythymidine triphosphate
Deoksitimidintrifosfatas
dTTP
Chemical structure of deoxyuridine monophosphate
Deoksiuridinmonofosfatas
dUMP
Chemical structure of deoxyuridine diphosphate
Deoksiuridindifosfatas
dUDP
Chemical structure of deoxyuridine triphosphate
Deoksiuridintrifosfatas
dUTP
Chemical structure of deoxycytidine monophosphate
Deoksicitidinmonofosfatas
dCMP
Chemical structure of deoxycytidine diphosphate
Deoksicitidindifosfatas
dCDP
Chemical structure of deoxycytidine triphosphate
Deoksicitidintrifosfatas
dCTP

Nukleotidų gavimas[taisyti | redaguoti kodą]

Iš nukleotidų sudarytos nukleino rūgštys, tad nukleotidai paprastai gaunami jas hidrolizuojant. Hidrolizuojant RNR šarmais gaunama nukleozid-2'-fosfatų ir nukleozid-3'-fosfatų mišinys. Paveikus DNR arba RNR įvairiais fermentais, susidaro ir nukleozid-5'-fosfatų. Nukleino rūgščių hidrolizės produktai rodo, kas rūgšties liekana nukleotiduose gali jungtis prie nukleozidų 2'-hidroksilo, 3'-hidroksilo arba 5'-hidroksilo grupių.

Nukleotidų funkcijos[taisyti | redaguoti kodą]

Nukleotidai įeina ne tik į nukleino rūgščių, bet ir į nukleotidinių kofermentų

Organizme būna ir laisvų nukleotidų. Nukleotidais vadinami ir nukleozid-5'-difosfatai ir trifosfatai. Šie polifosfatai yra labai svarbūs ląstelės bioenergetikai, ypač adenozin-5'-trifosfatas (ATP). Nukleozid-5'-trifosfatai yra nukleino rūgščių biosintezės substratai. Labai svarbūs yra ir nukleozid-3',5'-ciklofosfatai, ypač adenozin-3',5'-ciklofosfatas, kuris yra daugelio hormonų veikimo tarpininkas.


Commons-logo.svg Vikiteka: Nukleotidas – vaizdinė ir garsinė medžiaga

Vikiteka