Dabartinis klubas įkurtas 2014 m. ir dalyvauja SFL varžybose.
Klubo priešistorė tokia, kad Rūdiškėse buvo įkurtas (1996 m.) profesionalus futbolo klubas FK Vėtra, kuris pateko į elito lygą, A lygos pirmenybėse žaidė nuo 2001 m. iki 2010 m. vasaros, kai buvo pašalintas iš pirmenybių. 2003 m. tuometinis klubo prezidentas Romas Stašauskas buvo išrinktas naujai įkurtos Lietuvos futbolo klubų asociacijos (LFKA) direktoriumi. FK Vėtra išsikėlė į Vilnių (2004 m.), o vėliau (2010 m.) bankrutavo.
Mėgėjai 2014 m. atkūrė klubą „Vėtros” vardu, ir puoselėja futbolo tradicijas Rūdiškių miestelyje. Dalyvauja VRFS organizuojamuose turnyruose. Tai naujas klubas, ne pirmosios „Vėtros” tęsinys.
Šis straipsnis apie 2014 m. įkurtą futbolo klubą. Apie klubą, gyvąvusį 1996–2010 m. skaitykite straipsnyje FK Vėtra Vilnius.
