1995/96 m. Lietuvos futbolo 2 lygoje (antroji pakopa) Interas-AE Visaginas iškovojo 2 vietą.
1996/97 m. Lietuvos futbolo 2 lygoje (antroji pakopa) FK Avakona (Visaginas0 liko 12. (16 komandų pirmenybėse.)
1997/98 m. LFF I lyga (antroji pakopa) – FK Visaginas 14 vieta. Liko paskutiniai 14 komandų pirmenybėse.
1998/99 m. Lietuvos futbolo 2 lygoje (antroji pakopa) FK Visaginas užėmė 11 vietą (15 dalyvių). Įdomu, kad 5 vietą užėmė kitas Visagino klubas - Interas.[1]
2002 m. LFF II lygoje Rytų zonoje (antroji pakopa) KKSC Visaginas iš 7 dalyvių liko paskutinėje vietoje - septinti.
2012 ir 2013 metais Utenos apskrities pirmenybėse dalyvavo klubas Visaginas SC, nuo 2014 m. pradėjo dalyvauti II lygos pirmenybėse ir vadinosi FK Visaginas.
UAFA 2012 nugalėtojai - Visagino SC.
UAFA 2013 nugalėtojai - Visagino SC.
2014 m. LFF II lygos Pietų zonos pirmenybėse užimta dešimtoji vieta.
2015 m. LFF II lygos Rytų zonos pirmenybėse užimta šeštoji vieta.
2016 m. LFF II lygos Rytų zonos pirmenybėse užimta šeštoji vieta.