DNR superspiralizacija

DNR superspiralizacija – dvigubos DNR spiralės apsisukimas aplink save pačią tam, kad ji pakeistų savo topologiją.^[1] Superspiralizacija yra svarbi DNR suspaudimui.

Paprastai daugumos organizmų DNR yra neigiamai superspiralizuota.^[2] Tačiau yra ir organizmų, kurie turi negiamai superspiralizuotas DNR, pvz., kai kurie termofilai, mikroorganizmai, kurie gyvena ekstremaliomis sąlygomis – aukštose temperatūrose.^[3]

Matematinis aprašymas

DNR superspiralizaciją galima aprašyti naudojant tris dydžius:

sankibos laipsnį Lk
sūkių skaičių Tw
superspirališkumo laipsnį Wr

Jų sąryšis yra toks:

Lk=Tw+Wr

Lk nusako, kiek kartų DNR grandinės apsisuka viena aplink kitą. Jeigu grandinės sukasi viena apie kitą į dešinę, tai Lk yra teigiamas (žymima „+“), jeigu sukasi į kairę – neigiamas (žymima „-“)

Šaltiniai

↑ Benjamin Lewin, Jocelyn E. Krebs, Stephen T. Kilpatrick, Elliott S. Goldstein. Lewin’s Genes X. Mass. : Jones and Bartlett, 2011, 8 p. ISBN 9780763766320
↑ Champoux J (2001). „DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism“. Annu Rev Biochem. 70: 369–413. doi:10.1146/annurev.biochem.70.1.369. PMID 11395412.
↑ James D. Watson. Molecular Biology of the Gene. Benjamin Cummings, 2013, 96 p. ISBN 978-0-321-76243-6

Šis straipsnis apie biochemiją yra nebaigtas. Jūs galite prisidėti prie Vikipedijos papildydami šį straipsnį.

[1] Benjamin Lewin, Jocelyn E. Krebs, Stephen T. Kilpatrick, Elliott S. Goldstein. Lewin’s Genes X. Mass. : Jones and Bartlett, 2011, 8 p. ISBN 9780763766320

[Champoux-2] Champoux J (2001). „DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism“. Annu Rev Biochem. 70: 369–413. doi:10.1146/annurev.biochem.70.1.369. PMID 11395412.

[3] James D. Watson. Molecular Biology of the Gene. Benjamin Cummings, 2013, 96 p. ISBN 978-0-321-76243-6

[1]

[2]

[3]