Futbolo federacija kontroliuoja nacionalines vyrų ir moterų rinktines, taip pat organizuoja vyrų lygų bei taurės varžybas. Tik aukščiausias vyrų A lygos varžybas LFF pavedimu organizuoja Nacionalinė futbolo klubų asociacija. Nuo 1994 m. organizuoja moterų lygų varžybas, nuo 1996 m. – salės futbolo varžybas. Taip pat organizuoja paplūdimio futbolo varžybas.
Pirmosios tarpmiestinės futbolo rungtynės surengtos 1911 m., 1919 m. gegužės 18 d. Kaune įkuriama Lietuvos sporto sąjunga (LSS), 1920 m. LSS mėgino organizuoti futbolo čempionatą, bet neatsirado pakankamai norinčių komandų.
1922 m. įkurta Lietuvos sporto lyga (LSL), tais pačiais metais surengtas pirmasis čempionatas, kuriame varžėsi 10 Kauno komandų. 1923 m. LSL tapo FIFA nare. XX a. penktojo dešimtmečio pradžioje Tarybų Sąjungai okupavus Lietuvą, federacija išformuota. Atkūrus nepriklausomybė 1991 m. gruodžio 9 d. LFF sugrąžinta į FIFA, 1992 m. balandžio 23 d. tapo UEFA nare.