GC kiekis

Straipsnis iš Vikipedijos, laisvosios enciklopedijos.
Peršokti į: navigaciją, paiešką

G/C kiekis - molekulinėje biologijoje naudojamas rodiklis, guanino arba citozino nukleobazių procentinė dalis tiriamo organizmo DNR arba RNR. Šis rodiklis gali būti pamatuojamas keliais būdais, pvz, matuojant DNR lydymosi temperatūrą ar chromatografijos būdais.

GC kiekis varijuoja nuo 20 % iki beveik 80 % bakterijose, 26 - 61 % archeobakterijose, 35 -45 % gyvūnuose, 33 - 48 % augaluose, 36-67 % dumbliuose, 20-60 % grybuose, 20-66 % vienaląsčiuose (skaičiai +/-2 % tikslumu).

Vienodas GC kiekis gali parodyti lyginamų organizmų sąryšį priklausomai nuo situacijos, tačiau jei šis kiekis skiriasi daugiau nei 5 %, organizmai greičiausiai nesusiję. GC kiekis taip pat naudojamas PGR metoduose.

Apskaičiavimas[taisyti | redaguoti kodą]

G/C kiekis (procentinė vertė) apskaičiuojamas pagal formulę:

\cfrac{G+C}{A+T+G+C}\times\ 100 [1]


Gali būti naudojamas ir GC santykis, kurio formulė:

\cfrac{A+T}{G+C}[2].

Šaltiniai[taisyti | redaguoti kodą]

  1. Madigan, MT. and Martinko JM. (2003). Brock biology of microorganisms, 10th ed., Pearson-Prentice Hall. ISBN 84-205-3679-2.
  2. Definition of GC-ratio on Northwestern University, IL, USA